Bir WordPress Sitesi

Yapay zekâ (AlphaFold), moleküler dinamik (GROMACS) ve docking tekniklerini ücretsiz ve uygulamalı öğrenin.

Boğaziçi Üniversitesi

26 - 28 Aralık 2025

Ücretsiz

DESTEKLEYEN VE İŞ BİRLİĞİ YAPAN KURULUŞLAR

Boğaziçi Üniversitesi

İstanbul Medeniyet Üniversitesi

Sabancı Üniversitesi

Teoriği Pratiğe Dökün

Modern yapısal biyoloji, biyokimya ve ilaç tasarımı alanlarında kritik bir araştırma aracı haline gelen moleküler dinamik (MD) simülasyonlarını teorik ve pratik boyutlarıyla kapsamlı bir şekilde ele alın. Bu eğitim, katılımcılara proteinlerin dinamik yapısını anlamalarına yönelik derinlemesine bilgi sağlama amacını taşımaktadır.

Eğitim sonunda, GROMACS gibi açık kaynak yazılımlar kullanarak bir simülasyonu baştan sona başarıyla yürütme, RMSD, RMSF gibi analizleri değerlendirme yetkinliği kazanacak ve bu becerileri kendi araştırmalarınıza doğrudan entegre edebileceksiniz.

Neden Bu Eğitime Katılmalısınız?

Bu program, kariyerinize ve bilimsel araştırmalarınıza değer katacak eşsiz fırsatlar sunuyor

Türkiye'de Bir İlk

Ülkemizde bu altyapıyı ve kapsamı sunan ilk ve tek eğitim olma özelliğiyle fark yaratın.

GPU Destekli Simülasyon

Google Colab Pro ile kişisel PC’nize ihtiyaç duymadan, yüksek performanslı hesaplama gücüne erişin.

Uzman Akademik Kadro

Doç. Dr. Betül Uralcan, Prof. Dr. Canan Atılgan ve Dr. Ece Acuner Zorluuysal ile hesaplamalı biyolojinin ön saflarına adım atın

Projelerinize Değer Katın

Kendi araştırmalarınızda doğrudan kullanabileceğiniz pratik ve güncel beceriler kazanın.

Eğitmen Kadrosu

Alanında lider, deneyimli ve dinamik bir ekip

Prof. Dr. Canan Atılgan

Eğitmen

Sabancı Üniversitesi, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi

Doç Dr. Betül Uralcan

Etkinlik Yürütücüsü

Boğaziçi Üniversitesi, Kimya Mühendisliği

Dr. Öğr. Üyesi Saliha Ece Acuner

Eğitmen

İstanbul Medeniyet Üniversitesi, Biyomühendislik

Eğitim Programı ve Teknik Altyapı

Kapsamlı ders içeriği, en güncel teknolojilerle birleşiyor

Teorik Giriş

  • Protein yapısı ve PDB veri tabanı
  • MD simülasyonlarının fiziksel temelleri
  • Kuvvet alanları (Force Fields)
  • MMGBSA gibi ileri analiz yöntemleri
  • Görselleştirme araçları (PyMOL)

Uygulamalı Analiz

  • Sistem hazırlama ve simülasyon yürütme
  • Yapısal analizler (RMSD, RMSF, hidrojen bağları)
  • Serberst Enerji yüzeyleri ve enerji ayrıştırmaları
  • Yüzey özellikleri ve solvent erişilebilirlik analizi
  • Sonuç raporlanması ve biyolojik yorumlama

Eğitim boyunca, akademik ve endüstriyel standartlarda kabul görmüş, açık kaynaklı ve güçlü araçlar kullanılacaktır.

Google Colab

GROMACS

OpenMM

PyMOL

Bilimsel Yetkinliğinizi Bir Üst Seviyeye Taşıyın

Moleküler Biyoloji ve Genetik, Biyomühendislik, Tıp, Kimya gibi alanlardaki lisans, yüksek lisans ve doktora öğrencileri ile araştırmacıları bekliyoruz. Temel biyoloji/kimya bilgisi yeterlidir.

Kontenjan 25 kişi ile sınırlıdır.